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目前，我国棉纺织行业主要存在以下问题：
1、棉纺织行业产能问题
伴随着行业产能的增加，我国棉纺织行业也出现了很多的问题。主要有：第一，尽管产能增加，但大多数企业仍无利经营，这主要是因为各企业的生产规模差异较大，且以中小企业为主，使得棉纺织行业整体抵御市场风险的能力较弱，利润受损；第二，国内棉纺织行业产能一直处于过剩状态，企业开工率不足。在产能过剩的背景下，新建设的产能必然面临销售市场和盈利能力的巨大挑战，行业洗牌在所难免，而原材料价格的大幅波动将加速洗牌的过程，后期的产业集中度将提高，开工率不足的中小企业将面临倒闭或者被收购的命运。
2、棉纺织产业链存在问题
上游棉花价格波动较大。棉花价格的不稳定仍是目前棉纺织行业的首要问题，在棉花价格的大涨大跌行情中，受影响最大的是大量处于低端的中小企业，这些企业抗风险能力偏弱，许多企业停工或半停工，江浙一带的小型织布企业中已有大约1/3的企业“放假”，还有约1/5的小厂商已经开始卖机器，一些情况稍好的企业则在“咬牙硬撑”，这部分企业之所以不敢轻易停工，主要是因为停工后很难在短时间内再招到工人，货源和销售渠道都会受到影响。
下游服装行业出口量下降，行业利润减少。服装产业是棉纺织产业链的最末端，不仅实现纺织商品的供给，也是回收资金、实现产品价值、保证产业链正常运转的重要一环。近年来，国内服装品牌的增长速度较快，大批量生产降低成本的考虑使得服装企业对产品创新有所忽略，服装行业同质化竞争严重。而由于欧美经济的疲软，我国出口至该地区的服装数量明显下降，同时全球经济疲软、劳动力成本上升、原料价格波动剧烈、人民币升值的压力压缩着行业利润，服装企业不得不扩大非洲和东盟等地的市场份额，同时加大国内市场的营销力度，试图通过新的市场份额的增长来填补市场缺口。
3、棉纺织行业融资问题
我国的棉纺织行业以中小企业居多，“融资难”、“融资贵”成为行业内众多企业面临的问题。在纺织工业联合会近期进行的调研中，“融资”已经超越“订单”成为企业普遍反映的第一难题。在现行体制下，中小企业存在信用缺失，诚信系统不完善，容易产生拖欠和不还贷等问题，银行为了防范风险，不愿贷款给中小纺织企业。在当前纺织行业景气指数下滑的形势下，这种情况更加突出。
4、棉纺织行业出口问题
近年来，棉纺织行业出口遇冷主要是受到国际市场需求低迷、东南亚棉纺行业竞争和国内原材料成本上涨的影响。
国际市场需求仍然低迷。美国、日本和欧盟仍然是我国大陆棉纺织品的主要出口市场，但受到欧债危机的“蝴蝶效应”，使得国际市场对棉纺行业需求低迷。中国在欧洲和美国及其他发达经济体的棉纺织品市场份额出现下降的趋势。
东南亚国家棉纺行业和中国进行价格竞争。在低端棉纺织品市场上，我国的棉纺织企业同东南亚国家进行价格竞争，目前，东南亚国家棉纺织企业借助其在原材料以及劳动力成本等方面具有的比较优势，同中国棉纺织企业竞争国际市场份额。
国内原材料成本上涨。近年来，国内棉花价格居高不下，国内外原材料价差的扩大给中国的纺织企业带来了高原材料成本的压力，商业订单大量下降，中小规模单位有一缺乏订单而限制生产，甚至关门。受国内高价棉花影响，中国棉纺织品出口的价格优势不断被削弱，最终影响到棉纺织行业的出口。
针对以上问题，未来我国棉纺织行业应围绕科技发展和可持续发展两个主题，在科技进步、产业升级、结构调整、品牌建设、市场开拓以及效益提升等方面加大力度。在“十二五”期间，棉纺织行业发展的重点是努力提高产品的档次、质量，提高先进装备的水平，提高劳动生产力，加快淘汰高耗能设备，走智能化、低消耗、可持续绿色发展之路，利用科学管理模式提高企业效益，实现产业有序转移，促进区域协调发展。
